Seinäjoesta on ilmestynyt Jouko Niemelän laatima ja Juuret-toimikunnan kustantama talonhaltijamatrikkeli. Matrikkeli käsittää vuodet 1546-1808. Matrikkeliin on otettu talonhaltijoiden nimien ja hallinta-aikojen lisäksi mahdollisuuksien mukaan talonhaltijoiden ja heidän puolisoidensa syntymä-, kuolin- ja vihkiajat. Myös talonhaltijoiden ja heidän puolisoittensa vanhempien henkilötiedot on pyritty ottamaan mukaan.

Seinäjoen kolme ensimmäistä taloa Jouppi, Marttila ja Uppa on perustettu ennen vuotta 1546 ja Joupista erotettu Jouppila 1567. Vasta vuoden 1696 jälkeen Seinäjoelle alettiin perustaa uudistiloja. Tilojen määrä oli vuoteen 1808 menessä yhteensä 17. Vielä tämän jälkeen syntyi Korpikoski.

Vanhimmat kolme taloa perustettiin nähtävästi Ilmajoen keskusalueelta käsin, mutta varmuutta siitä ei ole. Lähes kaikki myöhemmät talot perustettiin seinäjokelaisten tai heidän naapuriensa voimin. Ainakin perustajat, joiden kotipaikka tiedetään, olivat tältä alueelta.

Seinäjoki pysyi Ilmajoen maalaiskylänä 1700-luvun lopulle. Vuonna 1798 Vaasalainen liikemies Abraham Falander alkoi rakentaa Yli-Marttilasta vuokraamalleen maalle rautaruukkia ja hän hankki omistukseensa Satamon ja ri Rintalan talot. Tulevana vuosisatana Seinäjoesta kehittyi ruukin ja rautatien myötä taajaväkinen yhdyskunta.